iSALE - Mac (OSX 10.8.5) へのインストールレポート Diff
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==事前準備
=== 1. Xcode の最新版を App store からダウンロードする．
(Xcode Version 5.0)
=== 2. Xcode の Command line tools をインストールする．
2.1) Mac 上で Xcodeを起動する．
2.2) Xcode のメニューから [Preferences] を選択する．
2.3) [General]パネルで [Downloads] をクリックする．
2.4) [Downloads] ウィンドウで [Complonents] タブを選択する．
2.5) [Command Line Tools] の横の [Install] ボタンをクリックする．
=== 3. Xquartz, MacPorts をそれぞれダウンロードし，インストールする．
==== Xquartz のダウンロードサイトは((<こちら|URL:http://xquartz.macosforge.org/landing/>))
各自の OS に合わせてダウンロードファイルを選択．
{{attach_view(kurosawa_xquartz.png)}}
==== Macports のダウンロードサイトは((<こちら|URL:http://www.macports.org/install.php>))
各自の OS に合わせてダウンロードファイルを選択．
{{attach_view(kurosawa_macport.png)}}
=== 5. Terminalを起動する．
5.1) Finderのメニューから「移動」を選択する．
5.2) 「アプリケーション」を選択する．
5.3) 「ユーティリティ」を選択する．
5.4) 「ターミナル.app」を起動する．
=== 6. Xcode のライセンス認証を行う．
以下を打ち込む．
sudo xcodebuild -liscense
英文の長文説明書きが出てくる．スペースを押すと，次の行に進む．
最後まで読むと自動的に終了する．
=== 7. MacPorts にパスを通す．
* 黒澤環境ではインストール時に自動で通ったらしい．
* Pathが自動で通っていない場合，以下のようにするらしい．
以下を打ち込み，「.bash_profile」をvi（エディタ）で編集する．
vi ~/.bash_profile
「i」を打ち込み，vi を入力モードにし，以下を追記する．
PATH=/opt/local/bin:/opt/local/sbin:$PATH
MANPATH=/opt/local/man:$MANPATH
"esc"ボタンで入力モードから離脱する．
以下を打ち込み，変更を保存する．
:w
以下を打ち込み，vi を終了する．
:q
=== 8. MacPorts の path が通っているか確認する．
以下を打ち込む．
port version
「Version: 2.2.0」と返ってくればOK．エラーが出る場合は手順7に戻る．
=== 9. MacPorts をアップデートする．
以下を打ち込む．
sudo port self update
黒澤の応答を次に示す．
{{attach_view(kurosawa_outou.png)}}
=== 10. Mac OSX へのインストール手引に従って各種プログラムをインストールする．
手引きは((<こちら|URL:http://www.isale-code.de/projects/isale/wiki/ISALE_on_Mac_OS_X_>))
* 以下を順次打ち込んでいく．
* 中にはインストールに数十分かかるものもある．
コマンドを打つとシステムのパスワードを聞かれるので，毎回打ち込む．
sudo port install python27
sudo port install gcc45
sudo port select gcc mp-gcc45
sudo port select python python27
sudo port install py27-ipython
sudo port install py27-scipy
sudo port install py27-matplotlib
sudo port install gnuplot
sudo port install qt3
sudo port install pgplot
sudo port install openmpi
sudo ln -s /opt/local/bin/openmpirun /opt/local/bin/mpirun
sudo ln -s /opt/local/bin/openmpiexec /opt/local/bin/mpiexec
※ 最後の 2 つはパスの確認．正常なら何も応答がない．
これで iSALE を Mac OS X (Mountain lion)にインストールするための下準備が完了．
== iSALE-Chicxulubをインストールする
インストールの手引きは((<こちら|URL:http://www.isale-code.de/redmine/projects/isale/wiki/Install_guide>))
=== iSALE-Chicxulub をダウンロードする．
※ 同じディレクトリに「iSALE-Chixulub」という名前のフォルダが自動で作られ，その中に格納される．
もし別の 「iSALE-Chixulub」が既存の場合は削除するか改名しておく．
svn co svn://earth.naturkundemuseum-berlin.de/iSALE/tags/chicxulub ./iSALE-Chicxulub
svn co --username kurosawa svn://earth.naturkundemuseum-berlin.de/iSALE/tags/chicxulub <現在のディレク トリまでのパス>
* このとき iSALE developer から受け取ったパスワードが必要になるので．手元に準備しておく．
* 現在のディレクトリまでのパスは pwd コマンドで調べることができる．入力時にはかっこ(<>)は不要．
* もちろん”kurosawa”は自分自身のユーザーネームに変更。
=== iSALE をインストールするための makefile を生成する．
以下を打ち込み「iSALE-Chixulub」ディレクトリに移動する．
cd iSALE-Chicxulub
以下を打ち込む．
# ./configure --prefix=<「install」ディレクトリまでのパス> --with-isaleplot --with-vimod
./configure --prefix=<インストールしたいディレクトリまでの絶対パス> --with-isaleplot --with-vimod
* 入力時にはかっこ(<>)は不要．
* --with-isaleplot --with-vimod は描画ソフト用のオプション．両方入れておいたほうが便利．
* --prefixで指定したディレクトリの下にshareディレクトリが作成され，ファイル等がその下に置かれます．svn co で採ってきたディレクトリの外でもOK．
* アウトプットの見本が手引に記載されているので、問題がなさそうか確認する．
=== コンパイルし，インストールする．
以下を打ち込む．
make
続いて以下を打ち込む
make install
黒澤環境でのアウトプットの抜粋
Making install in iSALE/example
+--------------------------------------------------------------+
+ Finished processing of examples
+--------------------------------------------------------------+
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Chicxulub/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Collision2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Collision3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Ice/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/MesoParticles2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Planet2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Planet3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Sand2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/SelfGravity2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/aluminum_1100_2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/aluminum_6061_2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/demo2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/demo3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/landslide/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/mesoscale2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/mesoscale3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/planar_eulerian_2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/planar_lagrangian_2D/
+--------------------------------------------------------------+
+ Finished processing of examples-installation
+--------------------------------------------------------------+
上記のように計算のサンプルが/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/フォルダに置かれる．
（+ 2015.4.8 鈴木追記）
リビジョン1575で試したところ，make install すると，エラーとなりました．（エラーメッセージはコピーし忘れ）
インストールディレクトリ（--prefix で指定したディレクトリ）に lib と include というディレクトリを作って，
中にいくつかファイルを置こうとするようなのですが，
lib と include のディレクトリが root の持ち物として作られておりユーザ（今の場合 suzuki）に書き込み権限がなかったためです．
そこで，以下のようにしてディレクトリのオーナーを変更し，
sudo chown suzuki lib
sudo chown suzuki include
その後再度 make install するとインストールできました．
=== 手引に従って，「iSALE2D」を走らせて，計算結果をプロットする．
以下を打ち込み「demo2D」ディレクトリに移動する．
cd share/examples/demo2D
以下を打ち込み、iSALE2D を走らせる．
./iSALE2D
※黒澤環境では数秒で計算が終了．
以下を打ち込み，「demo2D」ディレクトリの下にある同じ名前の「demo2D」ディレクトリに移動．
cd demo2D
以下を打ち込み，「iSALEPlot」で計算結果を描画する．
../iSALEPlot -f ../iSALEPlot.inp -m jdata.dat
成功すると「Plotting procedure complete. Have a nice day.」というメッセージがでる．
結果は「DamPre」ディレクトリに収納される．20 個ほどの .png ファイルができていれば，成功．
結果例
{{attach_view(Kurosawa_demo2D.png)}}
== 編集履歴とインストール環境
* 黒澤耕介（2013年12月9日）MacBook Air 2012 Mid (OS X 10.8.5)
* 鈴木絢子（2015年4月8日）Mac Pro (OS X 10.6.8) リビジョン 1575
=== 1. Xcode の最新版を App store からダウンロードする．
(Xcode Version 5.0)
=== 2. Xcode の Command line tools をインストールする．
2.1) Mac 上で Xcodeを起動する．
2.2) Xcode のメニューから [Preferences] を選択する．
2.3) [General]パネルで [Downloads] をクリックする．
2.4) [Downloads] ウィンドウで [Complonents] タブを選択する．
2.5) [Command Line Tools] の横の [Install] ボタンをクリックする．
=== 3. Xquartz, MacPorts をそれぞれダウンロードし，インストールする．
==== Xquartz のダウンロードサイトは((<こちら|URL:http://xquartz.macosforge.org/landing/>))
各自の OS に合わせてダウンロードファイルを選択．
{{attach_view(kurosawa_xquartz.png)}}
==== Macports のダウンロードサイトは((<こちら|URL:http://www.macports.org/install.php>))
各自の OS に合わせてダウンロードファイルを選択．
{{attach_view(kurosawa_macport.png)}}
=== 5. Terminalを起動する．
5.1) Finderのメニューから「移動」を選択する．
5.2) 「アプリケーション」を選択する．
5.3) 「ユーティリティ」を選択する．
5.4) 「ターミナル.app」を起動する．
=== 6. Xcode のライセンス認証を行う．
以下を打ち込む．
sudo xcodebuild -liscense
英文の長文説明書きが出てくる．スペースを押すと，次の行に進む．
最後まで読むと自動的に終了する．
=== 7. MacPorts にパスを通す．
* 黒澤環境ではインストール時に自動で通ったらしい．
* Pathが自動で通っていない場合，以下のようにするらしい．
以下を打ち込み，「.bash_profile」をvi（エディタ）で編集する．
vi ~/.bash_profile
「i」を打ち込み，vi を入力モードにし，以下を追記する．
PATH=/opt/local/bin:/opt/local/sbin:$PATH
MANPATH=/opt/local/man:$MANPATH
"esc"ボタンで入力モードから離脱する．
以下を打ち込み，変更を保存する．
:w
以下を打ち込み，vi を終了する．
:q
=== 8. MacPorts の path が通っているか確認する．
以下を打ち込む．
port version
「Version: 2.2.0」と返ってくればOK．エラーが出る場合は手順7に戻る．
=== 9. MacPorts をアップデートする．
以下を打ち込む．
sudo port self update
黒澤の応答を次に示す．
{{attach_view(kurosawa_outou.png)}}
=== 10. Mac OSX へのインストール手引に従って各種プログラムをインストールする．
手引きは((<こちら|URL:http://www.isale-code.de/projects/isale/wiki/ISALE_on_Mac_OS_X_>))
* 以下を順次打ち込んでいく．
* 中にはインストールに数十分かかるものもある．
コマンドを打つとシステムのパスワードを聞かれるので，毎回打ち込む．
sudo port install python27
sudo port install gcc45
sudo port select gcc mp-gcc45
sudo port select python python27
sudo port install py27-ipython
sudo port install py27-scipy
sudo port install py27-matplotlib
sudo port install gnuplot
sudo port install qt3
sudo port install pgplot
sudo port install openmpi
sudo ln -s /opt/local/bin/openmpirun /opt/local/bin/mpirun
sudo ln -s /opt/local/bin/openmpiexec /opt/local/bin/mpiexec
※ 最後の 2 つはパスの確認．正常なら何も応答がない．
これで iSALE を Mac OS X (Mountain lion)にインストールするための下準備が完了．
== iSALE-Chicxulubをインストールする
インストールの手引きは((<こちら|URL:http://www.isale-code.de/redmine/projects/isale/wiki/Install_guide>))
=== iSALE-Chicxulub をダウンロードする．
※ 同じディレクトリに「iSALE-Chixulub」という名前のフォルダが自動で作られ，その中に格納される．
もし別の 「iSALE-Chixulub」が既存の場合は削除するか改名しておく．
svn co svn://earth.naturkundemuseum-berlin.de/iSALE/tags/chicxulub ./iSALE-Chicxulub
svn co --username kurosawa svn://earth.naturkundemuseum-berlin.de/iSALE/tags/chicxulub <現在のディレク トリまでのパス>
* このとき iSALE developer から受け取ったパスワードが必要になるので．手元に準備しておく．
* 現在のディレクトリまでのパスは pwd コマンドで調べることができる．入力時にはかっこ(<>)は不要．
* もちろん”kurosawa”は自分自身のユーザーネームに変更。
=== iSALE をインストールするための makefile を生成する．
以下を打ち込み「iSALE-Chixulub」ディレクトリに移動する．
cd iSALE-Chicxulub
以下を打ち込む．
# ./configure --prefix=<「install」ディレクトリまでのパス> --with-isaleplot --with-vimod
./configure --prefix=<インストールしたいディレクトリまでの絶対パス> --with-isaleplot --with-vimod
* 入力時にはかっこ(<>)は不要．
* --with-isaleplot --with-vimod は描画ソフト用のオプション．両方入れておいたほうが便利．
* --prefixで指定したディレクトリの下にshareディレクトリが作成され，ファイル等がその下に置かれます．svn co で採ってきたディレクトリの外でもOK．
* アウトプットの見本が手引に記載されているので、問題がなさそうか確認する．
=== コンパイルし，インストールする．
以下を打ち込む．
make
続いて以下を打ち込む
make install
黒澤環境でのアウトプットの抜粋
Making install in iSALE/example
+--------------------------------------------------------------+
+ Finished processing of examples
+--------------------------------------------------------------+
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Chicxulub/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Collision2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Collision3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Ice/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/MesoParticles2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Planet2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Planet3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/Sand2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/SelfGravity2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/aluminum_1100_2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/aluminum_6061_2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/demo2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/demo3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/landslide/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/mesoscale2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/mesoscale3D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/planar_eulerian_2D/
installing example ..... /Users/kuro_mi/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/planar_lagrangian_2D/
+--------------------------------------------------------------+
+ Finished processing of examples-installation
+--------------------------------------------------------------+
上記のように計算のサンプルが/iSALE-Chicxulub/install/share/examples/フォルダに置かれる．
リビジョン1575で試したところ，make install すると，エラーとなりました．（エラーメッセージはコピーし忘れ）
インストールディレクトリ（--prefix で指定したディレクトリ）に lib と include というディレクトリを作って，
中にいくつかファイルを置こうとするようなのですが，
lib と include のディレクトリが root の持ち物として作られておりユーザ（今の場合 suzuki）に書き込み権限がなかったためです．
そこで，以下のようにしてディレクトリのオーナーを変更し，
sudo chown suzuki lib
sudo chown suzuki include
その後再度 make install するとインストールできました．
=== 手引に従って，「iSALE2D」を走らせて，計算結果をプロットする．
以下を打ち込み「demo2D」ディレクトリに移動する．
cd share/examples/demo2D
以下を打ち込み、iSALE2D を走らせる．
./iSALE2D
※黒澤環境では数秒で計算が終了．
以下を打ち込み，「demo2D」ディレクトリの下にある同じ名前の「demo2D」ディレクトリに移動．
cd demo2D
以下を打ち込み，「iSALEPlot」で計算結果を描画する．
../iSALEPlot -f ../iSALEPlot.inp -m jdata.dat
成功すると「Plotting procedure complete. Have a nice day.」というメッセージがでる．
結果は「DamPre」ディレクトリに収納される．20 個ほどの .png ファイルができていれば，成功．
結果例
{{attach_view(Kurosawa_demo2D.png)}}
== 編集履歴とインストール環境
* 黒澤耕介（2013年12月9日）MacBook Air 2012 Mid (OS X 10.8.5)
* 鈴木絢子（2015年4月8日）Mac Pro (OS X 10.6.8) リビジョン 1575